越来越多的科学证据显示，当我们祈祷、冥想或者斋戒时，大脑和身体内都会产生对健康有益的神奇化学反应，这也许可以证明宗教信仰在某种程度上可称为一剂健康良药，在我们的个人健康方面扮演着重要角色，甚至让我们在与疾病斗争的时候，多了一个选择。
假如你曾经如此专注地祈祷，以至忘记了自身之外那个宏观的世界，那么，这时候起作用的就是你的大脑顶叶。假如你曾经如此深深地冥想，以至发誓说体验到了天人合一的境界，那么，这时候起作用的还是你的大脑顶叶。此外，在这个过程中，丘脑和额叶也在共同发挥它们各自的作用，使得大脑成为一个“灵性游乐园”。
越来越多的科学证据表明，信仰真的会带给我们健康。美国迈阿密大学的精神病学和心理学教授Gail Ironson正在对艾滋病和宗教信仰进行研究，他说：“那些进行灵性冥想的病人，往往能有更好的疾病控制能力。例如，当你在跟艾滋病毒抗争的时候，你体内的病毒载量会降低，因为你的‘考的素’(一种压力荷尔蒙)水平会率先降低。”
过去15年来，对于大脑的灵性数据处理中心是如何工作的，美国宾夕法尼亚大学的放射医学和心理学教授Andrew Newberg博士进行了长期细致的观察和研究。Newberg和他的工作团队发现，当人们祷告时，大脑额叶起着主导作用，因为额叶统领人的精神专注状态。当人们处于极其深度的祷告中时，大脑顶叶暂停工作，这就是为什么此时人们会忘记自己的存在。有时候，额叶的活动会变得更加不活跃，此时做礼拜的人只是喃喃自语，却浑然不知自己在说什么。
一旦进行祷告和冥想的时间足够长，大脑里一些变化甚至会变成永久性的。将冥想视为生活一部分的人，比如那些有着15年甚至更长时间的冥想习练者，他们的大脑额叶组织比非冥想者更为稠密。那些信仰非常虔诚的信徒，他们的丘脑往往显示出不对称的特征。而其他人只有经过长达8周的冥想技巧训练之后，才能形成这一特征。这些特征无疑都将进一步改变大脑。大脑额叶的功能如果更强，就能帮助我们提高记忆力。Newberg对那些抱怨自己记性不好的人的脑部进行扫描后，发现接受冥想训练之后，他们大脑额叶的面积增大，记忆力也随之提高了。
人体有几大神经系统，其中与情绪有关的是自主神经系统，它们可以调节我们五脏六腑的功能运作。而心理学认为，祈祷、静坐和冥想之所以对我们的身心有一定的帮助，是因为当我们发生情绪突变时，或者处于长期压力之下，我们的自主神经系统会受到影响，进而影响到身体器官的运行。当人的情绪平和时，各个器官也就会在它的指挥下变得更协调。因此冥想和祷告时，身体的运行会变得平和。宗教信仰和健康在其他方面也有重合之处。以禁食为例。不论是作为传统的健康方式还是传统的宗教仪式，沐浴、禁食被认为首先可以排除体内毒素，其次能够清除罪孽，敬表虔诚。各种宗教信仰都有不同形式的斋戒。正确禁食，可以达到清洁的状态和极度愉快的情绪，另外，人体内部在禁食期间产生的化学反应也起了作用。
自1992年以来，美国得克萨斯大学的社会人口统计学家Robert Hummer一直在跟进一项研究，他所得出的研究结论令人难以辩驳。他发现，在随后8年里，那些从未去教堂做过礼拜的人，比那些每周做一次礼拜的人，其死亡率要高一倍；而去教堂做礼拜的次数介于两者之间的人，在随后8年里的死亡率也介于两者之间。美国匹兹堡大学医学中心的外科医生兼牧师Daniel Hall所进行的类似分析也发现，经常去教堂做礼拜的人寿命能够延长两到三年。